Único en su género y especializado en el tema de la cultura Guane, el Museo del mismo nombre posee dentro de su colección 750 piezas representativas de esta cultura que se asentara hace varios siglos, justo en la zona del Cañón del Chicamocha y de donde vienen las más arraigadas raíces del pueblo santandereano. La mayoría de las piezas se remontan a material de cerámica de la zona de Oiba y Charalá, así como de la parte baja de la mesa de los Santos, en especial las armas de madera, propulsores, hachas y lanzas.También hay una significativa muestra de textiles y collares en concha marina dado el comercio activo de intercambio que este grupo mantenía con los grupos de la zona de la costa atlántica.Variedad de mochilas y de gorros fabricados con pelo humano y collares hechos con semillas.Dentro de las piezas óseas, están varios cráneos deformados.